Cuando la cámara acorazada de la nave se abre, Tres se ve obligado a afrontar su pasado, mientras que Uno está distraído con un nuevo modelo de androide de entretenimiento.
Cuando Cuatro desaparece de la nave tras una parada en una estación espacial, la tripulación debe tomar una decisión: rescatar a su compañero o dejarle a su suerte.
El comandante Truffault ayuda a la tripulación a salir de una situación complicada, pero les mete en otra, haciendo que se alíen con otra tripulación para llevar a cabo una peligrosa misión.
Una operación de rescate en una remota instalación de investigación se convierte en un peligroso y sorprendente regreso de un miembro de la tripulación.
En el final de temporada de Dark Matter hay choques entre los miembros del equipo, se revelan antiguos secretos y la tripulación sufre una impactante traición.